149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0953 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  60.21 
 
 		 196 aa  238  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  42.78 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  41.99 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  38.92 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  41.85 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  36.7 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  39.29 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  39.78 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  42.62 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  34.97 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  41.21 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  36.14 
 
 		 169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  33.88 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  38.8 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  40.98 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  37.85 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  35.83 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  38.83 
 
 		 193 aa  127  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  35.83 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  35.91 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  35.91 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  35.54 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  35.52 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  38.3 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  34.41 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  37.78 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  33.88 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  34.83 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  34.83 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  36.84 
 
 		 300 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  40.68 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  36.16 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  37.85 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  36.96 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  37.04 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  37.04 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  37.04 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  37.04 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  37.04 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  37.04 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  36.96 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  36.51 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  37.95 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  36.75 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  36.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  36.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  36.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  36.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  36.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  36.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  36.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  36.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  36.96 
 
 		 207 aa  104  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  36.63 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  34.71 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  35.5 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  36.81 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  36.14 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  35.91 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  36.14 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  36.14 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  30.81 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  36.14 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  36.14 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  34.12 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  35.47 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  33.53 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  32.6 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  32.6 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  36.2 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2466  nitroreductase  36.02 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.294476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  34.88 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0809  hypothetical protein  36.02 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0371  nitroreductase  35.45 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.408673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  36.48 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  32.6 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  37.11 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  32.04 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  37.27 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2175  nitroreductase  37.16 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  36.2 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  35.06 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  34.34 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  35.4 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  33.15 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  33.15 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  33.13 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  32.04 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  31.32 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  33.9 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  33.75 
 
 		 182 aa  91.3  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  34.44 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  33.12 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  33.53 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  33.15 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>