More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0819 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
438 aa  899    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  58.29 
 
 
430 aa  534  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  55.76 
 
 
431 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  56.48 
 
 
431 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  58.53 
 
 
433 aa  530  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  55.3 
 
 
431 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  57.83 
 
 
430 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  58.53 
 
 
430 aa  525  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  57.41 
 
 
431 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  54.84 
 
 
431 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  58.16 
 
 
437 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  55.99 
 
 
430 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  54.15 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  53.69 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  56.02 
 
 
434 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  56.84 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  53.23 
 
 
431 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  54.38 
 
 
432 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  54.86 
 
 
451 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  53.7 
 
 
431 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  54.63 
 
 
451 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  53.23 
 
 
431 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  54.29 
 
 
431 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  54.4 
 
 
451 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  52.55 
 
 
431 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
435 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  52.78 
 
 
430 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 
431 aa  490  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  54.4 
 
 
431 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  54.4 
 
 
431 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
435 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
435 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
435 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
435 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
435 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
435 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
435 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
435 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  52.53 
 
 
433 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
435 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  52.78 
 
 
433 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
430 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  53.69 
 
 
435 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  53.01 
 
 
431 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
433 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  51.26 
 
 
432 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 
435 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 
435 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
435 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  52.19 
 
 
436 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 
435 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 
431 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  51.62 
 
 
431 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  51.61 
 
 
433 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  53.33 
 
 
431 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  51.62 
 
 
431 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  51.84 
 
 
430 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  50.68 
 
 
442 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 
431 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  51.51 
 
 
431 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  53.76 
 
 
425 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  50.69 
 
 
431 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  52.08 
 
 
431 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2095  adenylosuccinate lyase  51.13 
 
 
443 aa  473  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  51.38 
 
 
434 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  53.29 
 
 
427 aa  472  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  51.27 
 
 
431 aa  474  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  51.72 
 
 
434 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  51.16 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  51.8 
 
 
442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 
442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  51.15 
 
 
445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 
443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  51.85 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  51.49 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  52.11 
 
 
425 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  50.8 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 
438 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  52.07 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  50.81 
 
 
436 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  51.03 
 
 
438 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  51.72 
 
 
434 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  51.72 
 
 
434 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  52.82 
 
 
426 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 
431 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 
431 aa  461  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 
432 aa  462  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
439 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  51.5 
 
 
435 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1740  adenylosuccinate lyase  47.75 
 
 
442 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.483488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  51.77 
 
 
422 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  51.16 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>