35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0060 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0968    96.3 
 
 
2667 bp  2175    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000123752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.4 
 
 
987 bp  926    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1362    99.31 
 
 
2292 bp  2502    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.58 
 
 
987 bp  888    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1327    95.5 
 
 
1806 bp  1822    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.59 
 
 
987 bp  854    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99 
 
 
987 bp  950    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.99 
 
 
987 bp  944    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1184    99.77 
 
 
2430 bp  2549    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000163066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.58 
 
 
987 bp  888    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1538    96.46 
 
 
3196 bp  2189    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00606767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.39 
 
 
987 bp  886    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0990    97.24 
 
 
471 bp  831    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.657579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.8 
 
 
867 bp  942    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0938    95.24 
 
 
2182 bp  2060    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00251009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0912    96.46 
 
 
2427 bp  2189    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.39 
 
 
987 bp  886    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0633    98.1 
 
 
2044 bp  3318    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.061496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0562    97.92 
 
 
1831 bp  2353    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  95.39 
 
 
981 bp  807    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0380    95.43 
 
 
2159 bp  2916    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0144    97.17 
 
 
987 bp  870    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000023312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0102    98.36 
 
 
987 bp  904    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0060    100 
 
 
2292 bp  4544    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.301658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1069    92.89 
 
 
408 bp  579  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0942    94.65 
 
 
318 bp  496  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000806031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1537    96.97 
 
 
270 bp  460  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0244114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0089    92.52 
 
 
294 bp  408  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1758    96.8 
 
 
219 bp  379  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0848    97.74 
 
 
366 bp  319  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.103938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1072  hypothetical protein  93.57 
 
 
249 bp  252  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1071  hypothetical protein  94.85 
 
 
141 bp  214  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1421  hypothetical protein  100 
 
 
1677 bp  91.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0940  hypothetical protein  97.83 
 
 
705 bp  83.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000789536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  100 
 
 
1095 bp  71.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>