25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0056 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0056    100 
 
 		 609 bp  1207    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0364    94.26 
 
 		 588 bp  692    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0101  transposase  94.43 
 
 		 489 bp  442  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0255    95.31 
 
 		 279 bp  442  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.384648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  94.08 
 
 		 489 bp  434  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1209    92.47 
 
 		 1354 bp  404  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0806    93.19 
 
 		 609 bp  402  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0500044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1760  transposase  92.46 
 
 		 459 bp  345  9e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    92.46 
 
 		 5389 bp  345  9e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0291  transposase  88.85 
 
 		 489 bp  315  7.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0515999  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  88.11 
 
 		 837 bp  297  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0102    93.58 
 
 		 264 bp  276  7e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0017    91.98 
 
 		 339 bp  252  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1759  transposase  91.44 
 
 		 339 bp  244  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0900    88.41 
 
 		 796 bp  210  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00475035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  100 
 
 		 639 bp  155  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  80.07 
 
 		 834 bp  113  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0290  transposase  100 
 
 		 147 bp  111  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  79.36 
 
 		 834 bp  97.6  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1373    94.74 
 
 		 189 bp  89.7  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1256    89.86 
 
 		 429 bp  81.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  94.44 
 
 		 786 bp  56  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1130    90.24 
 
 		 105 bp  50.1  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  93.75 
 
 		 786 bp  48.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  93.75 
 
 		 786 bp  48.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>