38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4661 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  89.57 
 
 		 345 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  90.43 
 
 		 345 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  89.86 
 
 		 345 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  75.07 
 
 		 342 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  74.49 
 
 		 342 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  74.78 
 
 		 342 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  50.58 
 
 		 336 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  49.43 
 
 		 340 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  50.43 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  48.71 
 
 		 338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  51.16 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  32.74 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  30.91 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  29.7 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  29.52 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  29.52 
 
 		 337 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  29.22 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  29.7 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  29.7 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  28.96 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  28.36 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  26.96 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  27.7 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  26.82 
 
 		 360 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  30.59 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  24.92 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  22.01 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  24.03 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  22.92 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  23.42 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  25.23 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  23.21 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  22.1 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  24.04 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  31.93 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  25.3 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>