30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2753.2 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  99.18 
 
 
290 aa  259  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  100 
 
 
122 aa  258  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  98.36 
 
 
290 aa  257  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  97.54 
 
 
290 aa  256  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  92.62 
 
 
289 aa  245  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  92.62 
 
 
289 aa  245  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  92.62 
 
 
289 aa  245  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  92.62 
 
 
289 aa  245  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  90.91 
 
 
289 aa  243  7e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  79.34 
 
 
297 aa  216  9e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  78.51 
 
 
289 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  78.51 
 
 
286 aa  213  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  79.34 
 
 
289 aa  211  2e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  76.03 
 
 
289 aa  205  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  73.77 
 
 
289 aa  205  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  67.5 
 
 
289 aa  182  2e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  44.63 
 
 
291 aa  126  8e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  45.45 
 
 
290 aa  126  9e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  45.45 
 
 
287 aa  119  1e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  44.44 
 
 
294 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  43.22 
 
 
293 aa  110  8e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  42.37 
 
 
293 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  43.22 
 
 
292 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 
296 aa  61.6  3e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 
309 aa  59.3  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  27.97 
 
 
294 aa  47  8e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  27.97 
 
 
294 aa  47  8e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  36.23 
 
 
322 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  38.57 
 
 
280 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  26.45 
 
 
321 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>