26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0404 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2431  class I monoheme cytochrome c  88.37 
 
 		 129 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0928963  normal  0.0529755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0775  class I monoheme cytochrome c  86.82 
 
 		 139 aa  227  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  37.74 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0393  hypothetical protein  37.62 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789834  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2694  putative cytochrome c family protein  38.53 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.97531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0081  hypothetical protein  36.46 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.824718 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  46.91 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1186  hypothetical protein  33.85 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222804  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  37 
 
 		 644 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  35 
 
 		 649 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  34.04 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  36.46 
 
 		 643 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  33.33 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  41.82 
 
 		 664 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  54.84 
 
 		 637 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 702 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 702 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  45.71 
 
 		 314 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  40.48 
 
 		 296 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  43.86 
 
 		 248 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 254 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  43.59 
 
 		 653 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4942  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140936  unclonable  0.0000158871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3426  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  43.59 
 
 		 645 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>