48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5337 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  64.13 
 
 		 223 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  63.64 
 
 		 221 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  64.59 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  55.5 
 
 		 218 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  55.5 
 
 		 218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  55.5 
 
 		 218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  57.53 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  56.94 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  61.14 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  55.8 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  55.8 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  56.25 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  55.36 
 
 		 224 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  57.01 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  54.63 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  51.38 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  57.64 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  55.09 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  53.17 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  52.38 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  57.07 
 
 		 228 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  57.07 
 
 		 228 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  57.07 
 
 		 224 aa  227  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  57.07 
 
 		 224 aa  227  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  57.07 
 
 		 224 aa  227  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  57.07 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  57.07 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  51.82 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  66.27 
 
 		 169 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  52.26 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  47.49 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  48.77 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  43.69 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  34.67 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  37.34 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  34.17 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  34.43 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  31.4 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  29.58 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  31.52 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  26.53 
 
 		 449 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  29.03 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  28.23 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  28.66 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  24.21 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>