256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1421 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  239  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  81.74 
 
 		 115 aa  201  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  79.65 
 
 		 114 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  78.76 
 
 		 114 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  64.04 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  64.04 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  64.04 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  64.04 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  64.04 
 
 		 124 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  63.16 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  63.16 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  64.04 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  63.48 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  73.73 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  62.28 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  59.13 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  62.28 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  60 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  59.13 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  59.13 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  59.13 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  59.13 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  59.13 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  51.3 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1272  hypothetical protein  56.76 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.903502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  53.91 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  54.95 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  52.68 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  51.3 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  50.43 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  50.43 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  50.89 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  52.17 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  52.17 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  49.57 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  53.98 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  51.3 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  50.43 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  51.3 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  53.51 
 
 		 112 aa  119  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  51.35 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  48.21 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  53.15 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  44.35 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  46.09 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  53.1 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  46.09 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  54.05 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  51.33 
 
 		 115 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  50.89 
 
 		 118 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  43.75 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  54.05 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  49.14 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  48.65 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  47.83 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  51.35 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  47.79 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  50.45 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  47.41 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  49.56 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  43.97 
 
 		 117 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  49.56 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  49.56 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  49.56 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  49.56 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  48.65 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0590  arsenate reductase and related  44.83 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.419038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  43.48 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  48.65 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  47.79 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  49.09 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  45.95 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  48.62 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  47.79 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  45.69 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  47.75 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  47.75 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  46.85 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  47.75 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  47.75 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  44.64 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  39.13 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  42.24 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  47.75 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  49.54 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.95059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  43.75 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  50.46 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  45.13 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  42.34 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  46.79 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  41.67 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>