More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1206 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  91.7 
 
 		 241 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  82.99 
 
 		 241 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  82.16 
 
 		 241 aa  411  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  81.74 
 
 		 241 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  79.58 
 
 		 240 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  78.75 
 
 		 240 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  77.5 
 
 		 240 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  77.08 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  77.59 
 
 		 240 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  77.5 
 
 		 240 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  76.25 
 
 		 240 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  77.54 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  76.67 
 
 		 240 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  76.67 
 
 		 240 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  76.25 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  76.25 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  76.25 
 
 		 263 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  76.25 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  76.67 
 
 		 240 aa  374  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  76.25 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  76.25 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  76.25 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  58.16 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  61.51 
 
 		 243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  54.62 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.78 
 
 		 256 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  52.52 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  54.36 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  54.36 
 
 		 289 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  54.36 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  54.36 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  54.36 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  53.75 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  54.55 
 
 		 268 aa  252  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.46 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  51.25 
 
 		 270 aa  242  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  47.5 
 
 		 274 aa  241  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.88 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  53.78 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  49.79 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  49.79 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  52.7 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.12 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  42.44 
 
 		 242 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  42.02 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  41.6 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  41.6 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.1 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.7 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.84 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.57 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  43.04 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.44 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  48.12 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.77 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.77 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  41.49 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  41.35 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.64 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  44.73 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  43.98 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  44.74 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  42.8 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  40.59 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  43.83 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.66 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.02 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  43.78 
 
 		 274 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  43.64 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  40.82 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.87 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  40.93 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.15 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  43.1 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  45.19 
 
 		 266 aa  185  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.86 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  40.76 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  42.8 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  42.49 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  43.8 
 
 		 266 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  42.19 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.03 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  41.44 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.43 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  43.39 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  41.35 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.08 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  38.33 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  45.58 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.91 
 
 		 249 aa  178  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.25 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5226  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.5 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>