More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2467 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 		 391 aa  741    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  59.03 
 
 		 389 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.92 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  47.91 
 
 		 376 aa  363  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  56.3 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  51.72 
 
 		 393 aa  349  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.19 
 
 		 404 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  47.97 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.95 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.17 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  51.71 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  53.63 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  51.91 
 
 		 376 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  49.48 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.81 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  39.82 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.81 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  33.78 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  33.51 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  32.88 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  33.51 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  32.91 
 
 		 401 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  33.24 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  31.38 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  34.23 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  39.3 
 
 		 358 aa  176  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  31.61 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  33.1 
 
 		 453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.96 
 
 		 392 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  32.72 
 
 		 401 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.15 
 
 		 390 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  32.76 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  32.71 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.15 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  33.7 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  31.53 
 
 		 446 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  31.02 
 
 		 392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  28.09 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.92 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  31.76 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.65 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.34 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.6 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  32.62 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.53 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.82 
 
 		 450 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.48 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  32.98 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  32.67 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  31.89 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.88 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  31.1 
 
 		 456 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.01 
 
 		 457 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  32.68 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  32.46 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  32.46 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.25 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  30.35 
 
 		 454 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  31.19 
 
 		 456 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  33.24 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  28.51 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  31.27 
 
 		 412 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.52 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  30.46 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  28.99 
 
 		 455 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  30.79 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  31.52 
 
 		 460 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  31.73 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  31.94 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  30.9 
 
 		 450 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.17 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.46 
 
 		 441 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.97 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  28.42 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  30.54 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  30.13 
 
 		 467 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  30.71 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.64 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.82 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.15 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.35 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.29 
 
 		 469 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.69 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.28 
 
 		 469 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  33.23 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  30.81 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  30.62 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.27 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  33.71 
 
 		 425 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  31.85 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  27.16 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  32.31 
 
 		 413 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  27.23 
 
 		 393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  31.58 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  28.68 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  28.34 
 
 		 471 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  30.46 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  30.68 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  30.64 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>