More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0179 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.85 
 
 		 739 aa  739    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.39 
 
 		 730 aa  686    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.82 
 
 		 739 aa  749    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.99 
 
 		 739 aa  741    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.38 
 
 		 736 aa  650    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.94 
 
 		 737 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.99 
 
 		 739 aa  741    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.99 
 
 		 739 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.13 
 
 		 739 aa  740    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.79 
 
 		 733 aa  758    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.27 
 
 		 739 aa  739    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.4 
 
 		 765 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.81 
 
 		 803 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.88 
 
 		 767 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.93 
 
 		 760 aa  853    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.36 
 
 		 744 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.37 
 
 		 777 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.59 
 
 		 759 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.69 
 
 		 767 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.74 
 
 		 739 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.21 
 
 		 761 aa  871    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.45 
 
 		 761 aa  849    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.14 
 
 		 754 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.07 
 
 		 769 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.24 
 
 		 761 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.99 
 
 		 739 aa  741    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.95 
 
 		 779 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.46 
 
 		 777 aa  678    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.26 
 
 		 733 aa  788    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.99 
 
 		 759 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.99 
 
 		 739 aa  741    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.38 
 
 		 719 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.98 
 
 		 767 aa  719    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.61 
 
 		 758 aa  867    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.08 
 
 		 764 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.07 
 
 		 742 aa  801    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 		 758 aa  1538    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.24 
 
 		 741 aa  780    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.84 
 
 		 759 aa  707    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.53 
 
 		 750 aa  835    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.41 
 
 		 768 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.48 
 
 		 746 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.99 
 
 		 739 aa  741    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  53.68 
 
 		 727 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.56 
 
 		 744 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.31 
 
 		 743 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.44 
 
 		 742 aa  644    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.98 
 
 		 724 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.94 
 
 		 742 aa  793    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.2 
 
 		 775 aa  669    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.14 
 
 		 782 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.97 
 
 		 733 aa  803    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.94 
 
 		 739 aa  718    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.51 
 
 		 741 aa  653    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.87 
 
 		 737 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.34 
 
 		 761 aa  882    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.52 
 
 		 802 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.05 
 
 		 760 aa  859    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.27 
 
 		 739 aa  738    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.87 
 
 		 770 aa  854    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.94 
 
 		 779 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.06 
 
 		 779 aa  646    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.62 
 
 		 779 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.29 
 
 		 803 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.94 
 
 		 734 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.48 
 
 		 766 aa  633  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.37 
 
 		 738 aa  634  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.59 
 
 		 737 aa  632  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50 
 
 		 741 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.67 
 
 		 740 aa  628  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.53 
 
 		 737 aa  629  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.67 
 
 		 741 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.67 
 
 		 740 aa  628  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.72 
 
 		 751 aa  632  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.31 
 
 		 794 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.53 
 
 		 741 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.43 
 
 		 804 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.88 
 
 		 765 aa  626  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.2 
 
 		 741 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.67 
 
 		 735 aa  624  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.14 
 
 		 740 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.37 
 
 		 758 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.54 
 
 		 735 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.2 
 
 		 733 aa  625  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.55 
 
 		 754 aa  620  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.42 
 
 		 743 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.88 
 
 		 740 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.39 
 
 		 761 aa  616  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.37 
 
 		 729 aa  618  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.51 
 
 		 744 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.37 
 
 		 729 aa  618  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.67 
 
 		 749 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.08 
 
 		 787 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1505  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.64 
 
 		 743 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.09 
 
 		 729 aa  608  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.54 
 
 		 736 aa  612  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.03 
 
 		 764 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4417  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.46 
 
 		 761 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49 
 
 		 747 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.03 
 
 		 731 aa  608  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>