45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4048 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  349  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  97.63 
 
 		 169 aa  321  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  73.37 
 
 		 167 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  71.6 
 
 		 169 aa  256  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  60.95 
 
 		 167 aa  218  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  60.95 
 
 		 204 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  60.36 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  53.57 
 
 		 175 aa  180  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  46.71 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  47.02 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  46.39 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  42.59 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  38.79 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  40.12 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  34.87 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  34.21 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  34.04 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  34.97 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  33.57 
 
 		 227 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  34.75 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  32.45 
 
 		 209 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  33.56 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  28.33 
 
 		 182 aa  94  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  31.43 
 
 		 227 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  35.48 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  28.83 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  31.14 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  30.99 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  27.65 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  30.99 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  28.82 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  30.41 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  29.34 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  32.12 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  27.61 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  26.71 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  26.71 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  25.16 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  22.31 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  26.58 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  24.41 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  28.48 
 
 		 312 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  24.24 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1424  hypothetical protein  47.37 
 
 		 39 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4645  hypothetical protein  27.93 
 
 		 246 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>