More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3398 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  100 
 
 		 401 aa  811    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  86.78 
 
 		 401 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  87.03 
 
 		 401 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  62.07 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  60.34 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  53.35 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  45.01 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  44.67 
 
 		 403 aa  311  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.5 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  44.22 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  45.94 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.94 
 
 		 402 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.92 
 
 		 402 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.14 
 
 		 407 aa  299  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  44.39 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  42.46 
 
 		 426 aa  296  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  43.14 
 
 		 410 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  45.16 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  45.16 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  45.69 
 
 		 402 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  44.91 
 
 		 402 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.42 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  45.43 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  44.91 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  44.91 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  44.91 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  44.91 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.55 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.92 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2937  globin  44.01 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000130596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.6 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.5 
 
 		 409 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  44.42 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  41.26 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  43.84 
 
 		 393 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  43.31 
 
 		 411 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  39.5 
 
 		 396 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  44.5 
 
 		 422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.71 
 
 		 395 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  40 
 
 		 402 aa  282  9e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  40 
 
 		 402 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  40 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  39.75 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  40.5 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  38.96 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  39.75 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  39.75 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  42.04 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  39.5 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  39.75 
 
 		 402 aa  276  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3202  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.96 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  39 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  39.25 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  37.68 
 
 		 396 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  37.68 
 
 		 396 aa  269  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  38.75 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  39.6 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  37.44 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  38.75 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  38.75 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  38.6 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  38.75 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  38.85 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  38.5 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  38.85 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  38.9 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.9 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  38.9 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  38.9 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  38.9 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  38.9 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  38.9 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.2 
 
 		 386 aa  262  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  38.9 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  38.65 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  40.6 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  39.45 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  41.75 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  41.81 
 
 		 413 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.07 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.1 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39 
 
 		 412 aa  256  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  40.8 
 
 		 411 aa  255  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  39.1 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  39.46 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  41.04 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.1 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  37.93 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  39.6 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  38 
 
 		 397 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  37.53 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40 
 
 		 416 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1514  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.22 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.156255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  37.75 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  39.4 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  37.28 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22150  hemoglobin-like flavoprotein  40.82 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  40.2 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  38.77 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  40.85 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>