160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1538 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  567  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  92.83 
 
 		 277 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  92.47 
 
 		 277 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  78.99 
 
 		 281 aa  447  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  76.79 
 
 		 283 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  68.35 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  64.86 
 
 		 268 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  64.86 
 
 		 268 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  64.86 
 
 		 268 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  64.13 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  64.49 
 
 		 271 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  64.49 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  64.13 
 
 		 268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  65.22 
 
 		 272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  65.22 
 
 		 338 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  65.22 
 
 		 272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  65.22 
 
 		 272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  65.22 
 
 		 301 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  62.82 
 
 		 270 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  61.73 
 
 		 270 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  70.09 
 
 		 250 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  70.09 
 
 		 250 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  70.09 
 
 		 250 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  57.34 
 
 		 283 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  53.74 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  53.38 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  57.5 
 
 		 255 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  53.12 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  59.32 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  52.67 
 
 		 279 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  51.24 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  53.08 
 
 		 285 aa  278  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  53.23 
 
 		 250 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  56.49 
 
 		 265 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  48.77 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  57.71 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  50.66 
 
 		 256 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  49 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  46.38 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  42.91 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  45.27 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  45.27 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  45.95 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  45.45 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  44.59 
 
 		 251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  45.89 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  45.68 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  45 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  45 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  42.86 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  45 
 
 		 243 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  45.12 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  42.26 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  44.65 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  44.19 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  44.19 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  39.52 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  39.52 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  42.37 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  39.52 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  41.53 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  37.08 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  41.56 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  43.42 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  40.43 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  34.44 
 
 		 266 aa  151  8.999999999999999e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  41.38 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  39.06 
 
 		 384 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  39.92 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  35.68 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  38.58 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.99 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  37.8 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  38.71 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  36.76 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  36.61 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  38.82 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  38.13 
 
 		 332 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  38.46 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  37.45 
 
 		 332 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.25 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  35.97 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  37.07 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  36.63 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  37.65 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  34.87 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  36.68 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  36.55 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  36.44 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  36.07 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1750  hypothetical protein  38.43 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  38.46 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  34.94 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.21 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  36.11 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  36.48 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.11 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  27.64 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.33 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>