132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0924 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  99.6 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  97.61 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  94.42 
 
 		 251 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  85.66 
 
 		 251 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  86.45 
 
 		 251 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  84.46 
 
 		 251 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  80.95 
 
 		 252 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  84.03 
 
 		 243 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  79.28 
 
 		 251 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  79.28 
 
 		 251 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  51.29 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  48.16 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  48.43 
 
 		 258 aa  215  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  49.36 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  47.49 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  47.03 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  43.88 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  44.3 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  44.3 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  43.88 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  43.88 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  43.46 
 
 		 268 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  43.04 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  45.54 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  43.04 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  42.08 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  43.04 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  45.66 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  41.67 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  43.46 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  45.21 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  43.04 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  43.04 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  43.04 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  43.04 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  43.04 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  43.04 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  43.04 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  41.78 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  40.35 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  41.33 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  44.59 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  41.3 
 
 		 283 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  41.99 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  40.27 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  40.97 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  43.69 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  43.24 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  40.99 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  39.11 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  45.69 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  40.16 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  38.6 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  41.59 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  41.59 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  40.26 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  38.43 
 
 		 320 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.19 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.19 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.19 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  33.47 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  33.06 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  30.74 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  35.8 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  37.4 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  35.32 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  31.44 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  32.34 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.61 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  32.62 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  34.55 
 
 		 291 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  35.29 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  35.1 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  29.8 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1892  putative hemolysin  31.71 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185839  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  35.38 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  35.38 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  33.6 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  32.38 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  30.99 
 
 		 384 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.92 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  32.37 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  34.57 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  33.47 
 
 		 337 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  35.83 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.42 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.85 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  31.98 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1906  putative hemolysin-like protein  30.26 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  34.8 
 
 		 332 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  34.23 
 
 		 297 aa  99  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  32.5 
 
 		 321 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0395  hypothetical protein  31.92 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  32.11 
 
 		 315 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  31.73 
 
 		 330 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.2 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  30.68 
 
 		 332 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>