133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1750 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1750  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  38.43 
 
 
278 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  37.55 
 
 
277 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  35.32 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  37.12 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.09 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.09 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.09 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  32.13 
 
 
307 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  36.21 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  35.34 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  33.98 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.09 
 
 
268 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.73 
 
 
250 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  36.47 
 
 
268 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  35.71 
 
 
268 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  36.47 
 
 
268 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  35.56 
 
 
271 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.22 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  35.34 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.15 
 
 
270 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  35.71 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  35.71 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  35.29 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.06 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  35.71 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  35.71 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  33.2 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.01 
 
 
281 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  34.73 
 
 
270 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  33.96 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  34.18 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  33.75 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  31.01 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  35.15 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  31.17 
 
 
252 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.22 
 
 
243 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.34 
 
 
251 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  29.23 
 
 
271 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  33.06 
 
 
258 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  33.06 
 
 
258 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.07 
 
 
265 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  29.66 
 
 
251 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.54 
 
 
283 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  31.09 
 
 
285 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.87 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  29.24 
 
 
251 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  30.87 
 
 
278 aa  99  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  31.65 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  26.94 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  32.05 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  32.76 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  31.28 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.2 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  31.76 
 
 
286 aa  95.5  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  32.9 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  29.72 
 
 
279 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  30.86 
 
 
271 aa  92  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  29.34 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  28.52 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  28.63 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  28.19 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  28.19 
 
 
251 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  30.77 
 
 
253 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  28.19 
 
 
251 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.51 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  25.6 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  26.36 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  25.93 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.24 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.8 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0395  hypothetical protein  24.6 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  29.46 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  28.08 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.21 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.91 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.08 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.42 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.83 
 
 
626 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4506  hypothetical protein  25.19 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  27.27 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.77 
 
 
616 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  24.48 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  26 
 
 
291 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.67 
 
 
636 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.17 
 
 
662 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  24.07 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  28.14 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  26.69 
 
 
332 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2719  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  21.29 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  29.63 
 
 
332 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  25.38 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  27.42 
 
 
384 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  25.68 
 
 
337 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  26.4 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  30.13 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>