42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0819 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  66.67 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  29.92 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  35.44 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  39.74 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  33.73 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  30.26 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  26.92 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  30.38 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  31.33 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  33.77 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  30.67 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  35.14 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  30.95 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  31.65 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  36.99 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  29.11 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  29.11 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  29.11 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  28.24 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  29.89 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  31.03 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  31.65 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  29.89 
 
 		 179 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  28.21 
 
 		 157 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  28.95 
 
 		 150 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  31.15 
 
 		 148 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  35.48 
 
 		 141 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  29 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  28.71 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  33.75 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  29.35 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  30.59 
 
 		 136 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  29.21 
 
 		 179 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>