33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2215 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  98.51 
 
 		 151 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  69.4 
 
 		 151 aa  201  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  72.8 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  67.16 
 
 		 151 aa  193  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  65.6 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  47.37 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  43.18 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  40.46 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  41.6 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  43.2 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  37.59 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  39.1 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  39.26 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  39.55 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  38.81 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  40.3 
 
 		 167 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  42.22 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  38.81 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  40.88 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  38.06 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  40.15 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  39.1 
 
 		 164 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 167 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  35.34 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  34.85 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  37.59 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  34.71 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  30.4 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  32.61 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.39 
 
 		 145 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>