143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0408 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  92.58 
 
 
337 aa  642  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  693  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  86.83 
 
 
316 aa  573  1e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  75.39 
 
 
321 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  63.32 
 
 
332 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  63.32 
 
 
332 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  63.32 
 
 
332 aa  374  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  66.29 
 
 
384 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  63.23 
 
 
332 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  62.2 
 
 
330 aa  362  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  58.78 
 
 
315 aa  357  2e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  62.45 
 
 
332 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  62.36 
 
 
341 aa  332  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  56.51 
 
 
292 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  54.14 
 
 
291 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  54.96 
 
 
281 aa  292  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  53.61 
 
 
305 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  54.2 
 
 
297 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  50.17 
 
 
297 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  50.9 
 
 
296 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47407e-05 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  54.65 
 
 
291 aa  283  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  50.94 
 
 
304 aa  281  9e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  53.18 
 
 
291 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  45.45 
 
 
281 aa  216  3e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  46.85 
 
 
270 aa  217  3e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  43.7 
 
 
266 aa  214  1e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  47.64 
 
 
265 aa  213  3e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.2 
 
 
261 aa  201  1e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  43.2 
 
 
261 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  43.2 
 
 
261 aa  196  5e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  41.98 
 
 
258 aa  182  5e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.7 
 
 
258 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4506  hypothetical protein  40.08 
 
 
259 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  40.41 
 
 
253 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.2 
 
 
249 aa  147  2e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  35.55 
 
 
258 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  37.35 
 
 
270 aa  137  3e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  35.97 
 
 
278 aa  136  6e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  35.97 
 
 
277 aa  135  7e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.05 
 
 
250 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  36.96 
 
 
271 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  35.97 
 
 
277 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  33.88 
 
 
307 aa  135  1e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.96 
 
 
270 aa  134  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  34.26 
 
 
285 aa  134  2e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  132  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  34.39 
 
 
271 aa  131  1e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.36 
 
 
283 aa  129  7e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  32.38 
 
 
320 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.59 
 
 
265 aa  125  8e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  32.14 
 
 
258 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  32.14 
 
 
258 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.69 
 
 
281 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  35.77 
 
 
268 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  34.18 
 
 
286 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.02 
 
 
283 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  35.74 
 
 
272 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  35.74 
 
 
272 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  35.48 
 
 
268 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  35.74 
 
 
272 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  33.08 
 
 
256 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  35.48 
 
 
268 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  33.33 
 
 
277 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  35.63 
 
 
268 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  35.63 
 
 
268 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  35.74 
 
 
250 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  35.74 
 
 
250 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  35.74 
 
 
250 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  35.63 
 
 
268 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  35.34 
 
 
301 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.83 
 
 
294 aa  121  2e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  35.04 
 
 
338 aa  120  2e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  34.48 
 
 
282 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.72 
 
 
278 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  33.08 
 
 
279 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  33.72 
 
 
278 aa  119  8e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  34.08 
 
 
258 aa  118  2e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  31.85 
 
 
286 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  30.28 
 
 
280 aa  114  2e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  34.11 
 
 
261 aa  112  7e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  33.59 
 
 
249 aa  112  1e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  34 
 
 
253 aa  112  1e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  30.86 
 
 
283 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  33.87 
 
 
251 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  33.21 
 
 
256 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  30.08 
 
 
267 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1892  putative hemolysin  26.12 
 
 
251 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185839  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  31.87 
 
 
287 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  25.58 
 
 
266 aa  99.8  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.2 
 
 
251 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  32.08 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  32.53 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  32.05 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  32.48 
 
 
251 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  32.55 
 
 
251 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1707  putative acyl-CoA N-acyltransferases (Nat) superfamily protein  28.17 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189579  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  30.45 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>