38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3500 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  76.44 
 
 		 225 aa  351  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  29.05 
 
 		 249 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  30 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  31.58 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  30.27 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  29.03 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  28.9 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  27.98 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  28.8 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  25.39 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  25.68 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  28.25 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  28.11 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  24.75 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  27.89 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  27.47 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  27.22 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  26.04 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  26.63 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  26.04 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  25.6 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  25.44 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  25.44 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  25.52 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  23.73 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  25.41 
 
 		 306 aa  49.7  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  23.5 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  29.11 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  22.73 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  22.73 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1288  protein of unknown function DUF161  24.84 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  28.12 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  30.36 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  30.36 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  30.36 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  25.79 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  25.95 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>