More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1180 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  100 
 
 
414 aa  847  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  78.09 
 
 
414 aa  647  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  49.75 
 
 
403 aa  405  1e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  49.75 
 
 
403 aa  406  1e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  48.48 
 
 
399 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.59685e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  48.22 
 
 
398 aa  401  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.54307e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  47.69 
 
 
401 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  47.42 
 
 
398 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  49.12 
 
 
398 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  47.72 
 
 
399 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.13101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  46.72 
 
 
399 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  48.99 
 
 
401 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.22881e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  47.84 
 
 
397 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  45.78 
 
 
397 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  47.09 
 
 
396 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  47.33 
 
 
396 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  47.59 
 
 
405 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  9.04206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  47.46 
 
 
397 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  46.94 
 
 
417 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  48.6 
 
 
406 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  47.58 
 
 
397 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  47.45 
 
 
406 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.96 
 
 
398 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.45 
 
 
398 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  46.06 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  47.09 
 
 
396 aa  362  8e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  46.56 
 
 
400 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  46.56 
 
 
400 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  45.55 
 
 
397 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  43.72 
 
 
404 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  44.84 
 
 
401 aa  358  1e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  45.18 
 
 
397 aa  357  2e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.19259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  44.16 
 
 
395 aa  355  7e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.37028e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  45.69 
 
 
408 aa  355  9e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  1.79563e-09  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  45.18 
 
 
398 aa  354  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  47.21 
 
 
397 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  9.14313e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  46.15 
 
 
397 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  4.14678e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  44.78 
 
 
421 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.22438e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  47.07 
 
 
404 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  43.56 
 
 
421 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.41189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  43.21 
 
 
421 aa  348  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  46.82 
 
 
404 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  43.04 
 
 
397 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.98382e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  42.64 
 
 
397 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.29459e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  46.82 
 
 
404 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  46.82 
 
 
404 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  46.82 
 
 
404 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  43.4 
 
 
398 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  44.36 
 
 
421 aa  345  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.4561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  43.46 
 
 
421 aa  345  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  44.47 
 
 
401 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  44.11 
 
 
421 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  43.21 
 
 
421 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.52602e-11  hitchhiker  1.92642e-06 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  44.89 
 
 
402 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  46.33 
 
 
422 aa  342  6e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  44.95 
 
 
397 aa  342  7e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  45.39 
 
 
402 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  42.54 
 
 
417 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  8.35714e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  43.93 
 
 
452 aa  338  1e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  3.73865e-08 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  43.47 
 
 
404 aa  336  4e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  43.61 
 
 
402 aa  335  6e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  42.13 
 
 
398 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  45.09 
 
 
397 aa  333  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  44.02 
 
 
404 aa  333  4e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  44.33 
 
 
399 aa  332  8e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  42.89 
 
 
421 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  43.47 
 
 
409 aa  332  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  44.16 
 
 
397 aa  328  1e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  4.32075e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  43.22 
 
 
395 aa  327  2e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  44.42 
 
 
399 aa  328  2e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  41.27 
 
 
399 aa  327  2e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  45.64 
 
 
394 aa  327  2e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  44.7 
 
 
408 aa  326  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  42.47 
 
 
398 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  40.65 
 
 
406 aa  326  6e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  43.97 
 
 
399 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  43.36 
 
 
425 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  43.36 
 
 
415 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  43.72 
 
 
399 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  43.72 
 
 
399 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  43.73 
 
 
398 aa  323  4e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  41.69 
 
 
411 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  42.21 
 
 
404 aa  323  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  42.49 
 
 
398 aa  322  6e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  43.11 
 
 
425 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  43.6 
 
 
402 aa  322  7e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  42.38 
 
 
394 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  43.47 
 
 
399 aa  322  9e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  43.83 
 
 
400 aa  322  9e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  44.22 
 
 
402 aa  321  1e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  44.22 
 
 
402 aa  322  1e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  44.22 
 
 
402 aa  321  1e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>