180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4003 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  100 
 
 		 380 aa  760    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  86.84 
 
 		 380 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  80.38 
 
 		 373 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  67.74 
 
 		 381 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  53.13 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  49.73 
 
 		 377 aa  346  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  50.54 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  48.13 
 
 		 396 aa  328  9e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  47.96 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  52.46 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  49.73 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2728  O-methyltransferase family protein  49.46 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3695  O-methyltransferase family protein  52.86 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  44.02 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  46.2 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  45.92 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  44.51 
 
 		 379 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  43.09 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.9 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  29.3 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.9 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.9 
 
 		 362 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  29.32 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.57 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  29.41 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.11 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.11 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.11 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  28.66 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  29.88 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  28.32 
 
 		 375 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.35 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.2 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  29.53 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  29.45 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  37.32 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  30.09 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  30.03 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  30.03 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  30.03 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  30.03 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  30.03 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  30.03 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  28.57 
 
 		 361 aa  92.8  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  28.88 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.38 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.12 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.57 
 
 		 336 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  29.82 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  24.4 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  27.67 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  34.62 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  22.51 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  29.38 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  28.65 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  25.61 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  26.19 
 
 		 338 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  26.19 
 
 		 338 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  26.19 
 
 		 367 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  26.19 
 
 		 367 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  26.19 
 
 		 473 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  26.19 
 
 		 367 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  26.98 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  28.81 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  29.17 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  26.58 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  27.81 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  23.82 
 
 		 630 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  27.41 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  23.82 
 
 		 630 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  25.29 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  26.38 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  26.92 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.33 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  33.73 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  25.83 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  29.79 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  25.29 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  34.21 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  23.55 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  27.47 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  35.33 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  22.78 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  28.11 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  22.89 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  22.89 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  27.14 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  23.6 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  25.73 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  25.73 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  25.73 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  25.29 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  30.05 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  37.96 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  29.29 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  28.46 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  23.81 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  26.64 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  33.33 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7514  hypothetical protein  26.64 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>