24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0091 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  87.98 
 
 		 259 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  68.22 
 
 		 262 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  67.83 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  75.78 
 
 		 260 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  70.43 
 
 		 258 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  67.63 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.74 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.81 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.56 
 
 		 233 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.6 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  31.73 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.66 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.31 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  28.29 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.94 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.11 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.88 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  27.62 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  27.94 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  27.08 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.96 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  25.88 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.88 
 
 		 241 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>