More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2196 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  100 
 
 
220 aa  443  1e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  93.15 
 
 
220 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1137  urease accessory protein UreG  69.63 
 
 
216 aa  295  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  70 
 
 
214 aa  294  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  70 
 
 
214 aa  294  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  70.5 
 
 
214 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6188  urease accessory protein UreG  71.36 
 
 
208 aa  290  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1963  urease accessory protein UreG  72.73 
 
 
216 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  59.9 
 
 
208 aa  256  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0058  urease accessory protein UreG  66.16 
 
 
204 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418935  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  67.03 
 
 
206 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  58.59 
 
 
212 aa  243  2e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  52.76 
 
 
220 aa  224  5e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  52.76 
 
 
220 aa  224  5e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  52.76 
 
 
220 aa  224  5e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  54.27 
 
 
212 aa  224  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  55.28 
 
 
215 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  55.28 
 
 
215 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  54.73 
 
 
215 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  52.79 
 
 
202 aa  220  1e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1361  urease accessory protein UreG  53.27 
 
 
212 aa  219  2e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  56.85 
 
 
213 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  56.12 
 
 
211 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  3.01925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  53.27 
 
 
206 aa  216  3e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  54.27 
 
 
221 aa  212  3e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  51.78 
 
 
212 aa  212  3e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  58.12 
 
 
211 aa  211  6e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  50.51 
 
 
203 aa  211  6e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2663  urease accessory protein UreG  56.35 
 
 
249 aa  211  6e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093444 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  54.64 
 
 
201 aa  211  7e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  56.99 
 
 
204 aa  209  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  50 
 
 
217 aa  209  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  55.96 
 
 
211 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  53.06 
 
 
200 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  54.69 
 
 
209 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  54.87 
 
 
207 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  54.87 
 
 
207 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  51.27 
 
 
212 aa  206  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  54.74 
 
 
201 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  53.33 
 
 
209 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  55.21 
 
 
204 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  52.55 
 
 
205 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  51.43 
 
 
225 aa  204  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  51.55 
 
 
207 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  53 
 
 
211 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  54.01 
 
 
203 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  55.38 
 
 
206 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  54.59 
 
 
205 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0246  urease accessory protein UreG  50 
 
 
205 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  50 
 
 
206 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  47.21 
 
 
205 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  48.98 
 
 
204 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0695  urease accessory protein UreG  55.15 
 
 
279 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00707405  hitchhiker  6.49369e-08 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  48.98 
 
 
204 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  52.82 
 
 
210 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  54.59 
 
 
204 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  52.04 
 
 
203 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  54.45 
 
 
203 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  50.26 
 
 
203 aa  201  1e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  53.33 
 
 
207 aa  200  1e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  52.04 
 
 
204 aa  200  1e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  54.08 
 
 
204 aa  200  1e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  53.33 
 
 
207 aa  201  1e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  50.51 
 
 
205 aa  200  1e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  54.08 
 
 
204 aa  200  1e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  53.06 
 
 
204 aa  200  2e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  53.76 
 
 
201 aa  199  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  52.08 
 
 
204 aa  199  2e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  56.02 
 
 
202 aa  199  2e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  53.57 
 
 
204 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1874  urease accessory protein UreG  47.45 
 
 
204 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  49.49 
 
 
204 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06560  Urease accessory protein ureG, putative  52.82 
 
 
315 aa  199  4e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  51.53 
 
 
203 aa  198  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0328  urease accessory protein  49.75 
 
 
204 aa  198  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  50 
 
 
204 aa  197  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  52.69 
 
 
205 aa  197  8e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  52.08 
 
 
210 aa  197  1e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  51.81 
 
 
213 aa  197  1e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  52.24 
 
 
212 aa  197  1e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  51.56 
 
 
219 aa  196  2e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6443  urease accessory protein UreG  58.48 
 
 
226 aa  196  2e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187428  normal  0.14632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  49.48 
 
 
203 aa  195  5e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0274  urease accessory protein UreG  56.73 
 
 
240 aa  194  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  50.51 
 
 
204 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  50.77 
 
 
202 aa  194  8e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  53.16 
 
 
203 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  54.21 
 
 
203 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  51.83 
 
 
213 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  53.16 
 
 
203 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3407  urease accessory protein UreG  56.59 
 
 
250 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.893548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  51.02 
 
 
205 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  49.31 
 
 
215 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  48.24 
 
 
203 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  49.47 
 
 
203 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  52.04 
 
 
215 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  51.53 
 
 
215 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  51.53 
 
 
205 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0287  urease accessory protein UreG  52.33 
 
 
208 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0830  urease accessory protein UreG  52.15 
 
 
203 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>