21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0390 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  337  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  63.04 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  46.49 
 
 		 181 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  32.33 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  32.33 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  35.56 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  32.65 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  29.13 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  34.65 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  33.04 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  29.84 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  29.84 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  29.84 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  32.17 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  28.81 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  24.18 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  29.73 
 
 		 113 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>