More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0828 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 315 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  90.79 
 
 		 315 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  90.79 
 
 		 315 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  85.08 
 
 		 315 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  68.05 
 
 		 313 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  66.88 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  65.18 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  65.18 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  61.22 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  60.98 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  60.98 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  47.08 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  47.27 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  47.42 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  44.48 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  46.41 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  46.88 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  45.57 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  45.9 
 
 		 313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  44.04 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  38.03 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  42.59 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  47.79 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  43.63 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  42.22 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  40.2 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  34.75 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  36.48 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  40.71 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  37.87 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  44.81 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  44.81 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  39.23 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  34.84 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  38.71 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  45.58 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  41.19 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  37.25 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  38.06 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  41.35 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  35.4 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  32.04 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  32.04 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  38.68 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  34.15 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  32.08 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  37.13 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  32.45 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  35.27 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  35.27 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.7 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  42.01 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  39.78 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  35.88 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  37.81 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  31.08 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  31.08 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  32.56 
 
 		 306 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.33 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  39.38 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>