More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0534 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  69.54 
 
 		 456 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  67.61 
 
 		 449 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  68.2 
 
 		 456 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  67.4 
 
 		 449 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  77.97 
 
 		 456 aa  757    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  100 
 
 		 458 aa  946    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  69.15 
 
 		 449 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  63.46 
 
 		 456 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  52.34 
 
 		 448 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  52.65 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  51.79 
 
 		 445 aa  472  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  50.89 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 446 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  51.11 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  51.11 
 
 		 449 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  51.11 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  50.89 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  51.66 
 
 		 476 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  49.56 
 
 		 444 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  47.67 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  49.33 
 
 		 481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  51.21 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  49.67 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  51.42 
 
 		 463 aa  445  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  51.89 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  51.1 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  50 
 
 		 454 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  49.33 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  50.54 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  50.99 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  49.56 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  51.21 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  51.21 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  48.65 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  51.2 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  50.99 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  46.48 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  50.66 
 
 		 464 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 467 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  51.54 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  50.66 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  51.76 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  51.76 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  49.67 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  51.32 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  51.76 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  51.54 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  51.2 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  51.76 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  51.76 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 465 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  51.76 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  49.67 
 
 		 464 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  49.45 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  49.45 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  46.81 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  50.77 
 
 		 468 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  51.76 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  51.76 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 468 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  50.77 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  49.57 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  48.23 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  51.2 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  49.57 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  50.77 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  50.77 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  46.6 
 
 		 472 aa  428  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 462 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  48.91 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 451 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>