64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2533 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  925    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  57.77 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  59.21 
 
 
441 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  54.99 
 
 
465 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  54.99 
 
 
443 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  54.99 
 
 
465 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  54.99 
 
 
465 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  54.99 
 
 
465 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  54.99 
 
 
465 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  55.22 
 
 
465 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  51.97 
 
 
466 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  25.25 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  22.26 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  21.51 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  22.26 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  22.26 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  22.26 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  21.29 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 
457 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  22.48 
 
 
467 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 
457 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 
457 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  22.48 
 
 
467 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  22.48 
 
 
467 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  22.48 
 
 
411 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  22.48 
 
 
467 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  22.48 
 
 
467 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  22.48 
 
 
467 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  24.74 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  24.74 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  24.74 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  24.74 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  24.74 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  24.74 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0487  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  25.89 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  25.89 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  22.04 
 
 
469 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  25.89 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  25.89 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  25.89 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0257  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  25.89 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3787  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2861  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0503  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0484  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0530  transposase, IS4 family protein  24.14 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  30.23 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  22.48 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  24.23 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>