34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0985 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0862  hypothetical protein  81.13 
 
 		 68 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.228187  normal  0.355021 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  32.53 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  25.73 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  28.21 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  28.64 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  23.94 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  29.95 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  28.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  28.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  28.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  28.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  26.18 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  25.13 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  24.18 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  29.74 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  24.74 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  24.21 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  27.78 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  25.95 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  24.84 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  24.74 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  24.84 
 
 		 273 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>