262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0766 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 39 aa  63.9  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  71.05 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1316  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000142066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1370  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2041  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658877  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2206  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  65.79 
 
 		 39 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2400  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000387542  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  63.16 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 41 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  65.79 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2273  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158298  hitchhiker  0.00291213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4003  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000226529  hitchhiker  0.0000138674 
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 55 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  60.53 
 
 		 39 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.5  0.0000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3158  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3295  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  68.42 
 
 		 37 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0267  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  68.42 
 
 		 37 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  51.6  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>