23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0358 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  300  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  49.64 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  46.27 
 
 
162 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  33.81 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  37.24 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  38.46 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  35 
 
 
438 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  38.24 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  33.33 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  38.46 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  32.35 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  35.21 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  34.78 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  37.08 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  35.87 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  34.92 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  29.13 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  35.48 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  24.66 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  24 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  25 
 
 
326 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  25.24 
 
 
314 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>