More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3244 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  64.61 
 
 		 469 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  68.52 
 
 		 469 aa  704    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  75.59 
 
 		 469 aa  762    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  73.22 
 
 		 469 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  76.67 
 
 		 469 aa  767    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  68.74 
 
 		 468 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  64.39 
 
 		 469 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  64.39 
 
 		 469 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  76.03 
 
 		 470 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  76.46 
 
 		 469 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  71.3 
 
 		 486 aa  704    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0147  L-glutamine synthetase  67.83 
 
 		 469 aa  673    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0281822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  67.8 
 
 		 470 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  75.38 
 
 		 469 aa  761    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  644    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1216  glutamine synthetase, type I  76.08 
 
 		 469 aa  743    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  73.76 
 
 		 471 aa  746    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  68.09 
 
 		 477 aa  691    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  645    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  68.87 
 
 		 469 aa  678    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  75.81 
 
 		 469 aa  769    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  74.73 
 
 		 469 aa  754    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  75.43 
 
 		 469 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  65.59 
 
 		 469 aa  656    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  76.67 
 
 		 469 aa  767    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1515  L-glutamine synthetase  66.81 
 
 		 468 aa  661    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  76.03 
 
 		 470 aa  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  76.72 
 
 		 469 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  76.19 
 
 		 469 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  76.13 
 
 		 469 aa  768    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  76.08 
 
 		 469 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  75.76 
 
 		 469 aa  749    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  64.39 
 
 		 469 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  76.08 
 
 		 469 aa  754    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  67.24 
 
 		 468 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  68.53 
 
 		 470 aa  677    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  63.97 
 
 		 469 aa  634    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  73.55 
 
 		 469 aa  753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  74.78 
 
 		 469 aa  747    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0427  glutamine synthetase, type I  75.33 
 
 		 469 aa  732    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  76.67 
 
 		 469 aa  767    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  64.39 
 
 		 469 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  75.59 
 
 		 469 aa  763    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1330  L-glutamine synthetase  70.84 
 
 		 467 aa  707    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.523028  normal  0.654119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  76.19 
 
 		 469 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  65.03 
 
 		 469 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  64.61 
 
 		 469 aa  645    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1344  glutamine synthetase, type I  67.61 
 
 		 469 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 468 aa  979    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  68.74 
 
 		 468 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1780  glutamine synthetase, type I  67.83 
 
 		 469 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  64.39 
 
 		 469 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  64.61 
 
 		 469 aa  642    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  63.75 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  63.33 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  63.54 
 
 		 469 aa  634  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  63.54 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  63.33 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  63.11 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  62.69 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  63.75 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  62.28 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  62.72 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  62.07 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  62.5 
 
 		 471 aa  614  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  62.5 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  62.07 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  63.54 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  62.72 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  62.07 
 
 		 471 aa  614  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  63.54 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  62.07 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  64.07 
 
 		 467 aa  614  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  62.72 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  62.07 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  63.33 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  62.72 
 
 		 471 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5002  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  62.45 
 
 		 471 aa  614  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  61.83 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  61.85 
 
 		 471 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1109  glutamine synthetase, type I  62.5 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  62.28 
 
 		 471 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>