More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2303 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  100 
 
 
230 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  44.24 
 
 
217 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  47.12 
 
 
217 aa  164  1e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.49 
 
 
228 aa  162  4e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.53 
 
 
228 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.23 
 
 
232 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.32 
 
 
219 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  39.82 
 
 
223 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  37.91 
 
 
212 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  50.51 
 
 
245 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  45.79 
 
 
225 aa  152  3e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  44.5 
 
 
228 aa  152  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  41.98 
 
 
218 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  46.56 
 
 
223 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  44.21 
 
 
222 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.03 
 
 
231 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  43.52 
 
 
218 aa  148  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  40.93 
 
 
235 aa  147  2e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  42.99 
 
 
216 aa  144  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.08 
 
 
223 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  42.2 
 
 
219 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.52 
 
 
223 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  47.06 
 
 
228 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.92 
 
 
214 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  45.99 
 
 
228 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  41.01 
 
 
242 aa  140  1e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  45.99 
 
 
228 aa  140  1e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  40.47 
 
 
219 aa  141  1e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.36 
 
 
223 aa  140  2e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  40.45 
 
 
227 aa  139  4e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  41.67 
 
 
230 aa  138  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  40.32 
 
 
248 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  43.26 
 
 
227 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  41.21 
 
 
208 aa  136  3e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.4 
 
 
229 aa  136  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  37.97 
 
 
224 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  39.71 
 
 
204 aa  134  1e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.33 
 
 
229 aa  132  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  39.04 
 
 
224 aa  130  2e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  39.57 
 
 
246 aa  130  2e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  37.96 
 
 
229 aa  129  4e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
233 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  38.14 
 
 
225 aa  127  1e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
223 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  39.53 
 
 
230 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.14 
 
 
226 aa  125  4e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
222 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  33.81 
 
 
228 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  40.48 
 
 
223 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
230 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  39.8 
 
 
223 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  39.8 
 
 
223 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4162  6-phosphogluconate phosphatase  37.67 
 
 
222 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  37.32 
 
 
224 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  36.51 
 
 
221 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  33.81 
 
 
260 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  35.56 
 
 
228 aa  121  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  35.56 
 
 
228 aa  121  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4188  6-phosphogluconate phosphatase  36.77 
 
 
222 aa  120  2e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274934  hitchhiker  0.00681346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4240  6-phosphogluconate phosphatase  36.77 
 
 
222 aa  120  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  33.49 
 
 
240 aa  120  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  120  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  120  2e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.43 
 
 
229 aa  120  2e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
230 aa  120  2e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  39.58 
 
 
237 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  33.51 
 
 
221 aa  119  4e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  119  5e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  119  5e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 
232 aa  119  5e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
240 aa  119  5e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  35.85 
 
 
237 aa  119  5e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  35.11 
 
 
221 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  35.47 
 
 
255 aa  117  1e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.89 
 
 
231 aa  117  2e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  36.98 
 
 
229 aa  116  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
218 aa  116  2e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
244 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
244 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  35.64 
 
 
221 aa  115  4e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  115  4e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  115  4e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  35.64 
 
 
221 aa  115  4e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  115  4e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.64 
 
 
221 aa  115  4e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
228 aa  115  4e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  32.72 
 
 
214 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  43.55 
 
 
217 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  35.11 
 
 
221 aa  115  8e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  37.16 
 
 
231 aa  114  9e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 
240 aa  114  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  36.51 
 
 
221 aa  114  2e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.05 
 
 
229 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5788  HAD family hydrolase  37.33 
 
 
227 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
230 aa  112  7e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  111  1e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.26 
 
 
229 aa  111  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.73 
 
 
230 aa  110  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  0.049198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  32.58 
 
 
229 aa  110  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>