More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2101 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
267 aa  539  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  64.23 
 
 
263 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  65.37 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  64.59 
 
 
263 aa  355  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  64.73 
 
 
262 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  64.73 
 
 
262 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  63.12 
 
 
265 aa  349  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  63.42 
 
 
264 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  62.79 
 
 
262 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  62.02 
 
 
262 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  61.78 
 
 
263 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  61.96 
 
 
263 aa  338  5e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  62.6 
 
 
263 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  61.07 
 
 
264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  60.62 
 
 
263 aa  335  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  61.18 
 
 
266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  62.31 
 
 
264 aa  334  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  60.23 
 
 
263 aa  333  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  61.54 
 
 
264 aa  333  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  61.54 
 
 
264 aa  333  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  58.69 
 
 
262 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  61.18 
 
 
266 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  61.15 
 
 
264 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  60 
 
 
265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2740  inositol monophosphatase  64.17 
 
 
263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0333138  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  60 
 
 
263 aa  325  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  59.29 
 
 
266 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  61.57 
 
 
266 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  60.78 
 
 
266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2981  inositol-phosphate phosphatase  56.46 
 
 
273 aa  304  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1501  inositol monophosphatase  56.3 
 
 
278 aa  289  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.421731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.63 
 
 
272 aa  285  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.837993  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1957  inositol-1(or 4)-monophosphatase  58.91 
 
 
274 aa  281  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1707  inositol-phosphate phosphatase  54.78 
 
 
275 aa  278  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.168895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  51.75 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  50.97 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  50.97 
 
 
261 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  50.97 
 
 
261 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.1 
 
 
264 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0707  inositol monophosphatase  51.55 
 
 
262 aa  268  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  50 
 
 
264 aa  258  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  47.35 
 
 
270 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.17 
 
 
267 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  45.38 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  46.06 
 
 
255 aa  233  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  45.98 
 
 
267 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  44.18 
 
 
259 aa  230  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  43.3 
 
 
283 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  48.39 
 
 
271 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  42.8 
 
 
266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  45.9 
 
 
267 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  45.9 
 
 
267 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.8 
 
 
263 aa  225  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  44.36 
 
 
271 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.92 
 
 
330 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  46.39 
 
 
266 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.31 
 
 
265 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  42.19 
 
 
267 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  41.76 
 
 
267 aa  222  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  42.97 
 
 
267 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  42.97 
 
 
267 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  42.97 
 
 
267 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  42.97 
 
 
267 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  43.85 
 
 
267 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0546  Inositol-phosphate phosphatase  45.95 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  46.61 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  42.19 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  43.28 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  41.54 
 
 
261 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  41.54 
 
 
261 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  42.58 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  42.19 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  42.19 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.53 
 
 
273 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  45.78 
 
 
272 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  46.37 
 
 
271 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  46.18 
 
 
272 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  45.78 
 
 
272 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.7 
 
 
259 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  44.36 
 
 
284 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  43.02 
 
 
267 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  43.02 
 
 
267 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  43.02 
 
 
267 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  43.02 
 
 
267 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  41.18 
 
 
266 aa  216  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  46.18 
 
 
272 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  43.02 
 
 
267 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  43.02 
 
 
267 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  42.74 
 
 
288 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  43.02 
 
 
267 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  43.02 
 
 
267 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  43.02 
 
 
267 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  43.19 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  41.63 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0161  extragenic suppressor protein SuhB  43.93 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  45.42 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.68 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  43.51 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  43.35 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.38 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>