161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1910 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1910  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  622  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0184163  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2707  metallophosphoesterase  52.54 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  47.24 
 
 		 1138 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1831  hypothetical protein  48.73 
 
 		 427 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2270  hypothetical protein  46.13 
 
 		 454 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  35.09 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  34.98 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  33.22 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  34.58 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0277  hypothetical protein  33.56 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  32.13 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  30.57 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  29.19 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  28.47 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  28.12 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  28.71 
 
 		 338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  29.32 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  28.76 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  28.92 
 
 		 323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  28.24 
 
 		 337 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  28.28 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  26.95 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  26.94 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  27.53 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  27.62 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  27.12 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  23.84 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  31.13 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  32.89 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.91 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  39.19 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.91 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  27.08 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  24.14 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0908  diadenosine tetraphosphatase  31.34 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  23.53 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0922  diadenosine tetraphosphatase  38.46 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0753757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  30.2 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  27.4 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0165  metallophosphoesterase  34.44 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  31.03 
 
 		 847 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.8 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  30.99 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  31.96 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  30.65 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1518  diadenosine tetraphosphatase  23.21 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  26.95 
 
 		 282 aa  49.3  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  39.19 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04713  Ser/Thr protein phosphatase family (AFU_orthologue; AFUA_5G08620)  36.36 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  38.46 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  32.94 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  39.47 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  40.54 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  28.96 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  39.24 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  38.46 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  38.46 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  35 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  38.37 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  27.14 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0987  diadenosine tetraphosphatase  29.2 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.341125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  31.76 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  37.18 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1850  diadenosine tetraphosphatase  23.66 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0962  diadenosine tetraphosphatase  35.44 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  37.04 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  40.54 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  37.18 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2193  diadenosine tetraphosphatase  23.66 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  40.54 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  34.18 
 
 		 847 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  26.99 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.61 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1143  diadenosine tetraphosphatase  29.69 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281223  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  36 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  38.37 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3200  diadenosine tetraphosphatase  32.35 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.238496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 830 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  27.53 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  22.49 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  24.63 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1012  diadenosine tetraphosphatase  31.5 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.493467  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  33.77 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3081  diadenosine tetraphosphatase  30.71 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3856  diadenosine tetraphosphatase  34.15 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  28.57 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1455  diadenosine tetraphosphatase  34.18 
 
 		 280 aa  45.8  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  36 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  34.83 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  37.04 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1044  diadenosine tetraphosphatase  29.01 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2085  diadenosine tetraphosphatase  35.14 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1077  diadenosine tetraphosphatase  29.01 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>