More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0168 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0206  diadenosine tetraphosphatase  56.98 
 
 		 275 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  56.34 
 
 		 277 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  59.7 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  56.41 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  57.42 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2384  diadenosine tetraphosphatase  52.77 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3027  diadenosine tetraphosphatase  53.02 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0223  diadenosine tetraphosphatase  53.24 
 
 		 279 aa  285  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1143  diadenosine tetraphosphatase  52.33 
 
 		 281 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281223  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2736  diadenosine tetraphosphatase  54.24 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3856  diadenosine tetraphosphatase  50.54 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1064  diadenosine tetraphosphatase  51.97 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1149  diadenosine tetraphosphatase  53.93 
 
 		 280 aa  278  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3200  diadenosine tetraphosphatase  50.35 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.238496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2156  diadenosine tetraphosphatase  52.5 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1518  diadenosine tetraphosphatase  50.18 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2728  diadenosine tetraphosphatase  50.37 
 
 		 270 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4629  diadenosine tetraphosphatase  49.44 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0876  diadenosine tetraphosphatase  49.08 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1345  diadenosine tetraphosphatase  52.21 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.399511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1468  diadenosine tetraphosphatase  51.48 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.85659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0711  diadenosine tetraphosphatase  50.74 
 
 		 277 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 		 279 aa  265  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  45.79 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0549  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase, symmetrical  48.33 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  49.26 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  49.45 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0681  diadenosine tetraphosphatase  51.62 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3968  diadenosine tetraphosphatase  49.82 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383712  normal  0.638877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  51.09 
 
 		 282 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3805  diadenosine tetraphosphatase  48.35 
 
 		 292 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2321  diadenosine tetraphosphatase  49.26 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1046  diadenosine tetraphosphatase  45.99 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.78168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0573  diadenosine tetraphosphatase  50.72 
 
 		 296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0841  diadenosine tetraphosphatase  48.2 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290055 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  48.63 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0388  diadenosine tetraphosphatase  48.74 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0870  diadenosine tetraphosphatase  48.74 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  49.44 
 
 		 272 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1340  diadenosine tetraphosphatase  51.28 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00498916  hitchhiker  0.000879118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46850  diadenosine tetraphosphatase  49.1 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2518  diadenosine tetraphosphatase  48.18 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.284049 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2853  diadenosine tetraphosphatase  52.61 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  49.05 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2993  diadenosine tetraphosphatase  52.24 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0666  diadenosine tetraphosphatase  49.07 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2752  diadenosine tetraphosphatase  51.11 
 
 		 282 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.541126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1991  diadenosine tetraphosphatase  51.11 
 
 		 282 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0922  diadenosine tetraphosphatase  51.11 
 
 		 282 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1853  diadenosine tetraphosphatase  51.11 
 
 		 282 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  47.16 
 
 		 288 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3164  diadenosine tetraphosphatase  51.11 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3106  diadenosine tetraphosphatase  51.11 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3142  diadenosine tetraphosphatase  51.11 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  47.16 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  47.16 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1197  diadenosine tetraphosphatase  49.09 
 
 		 278 aa  249  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0643097  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0743  diadenosine tetraphosphatase  47.25 
 
 		 279 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0760  diadenosine tetraphosphatase  47.08 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  44.7 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  47.21 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  46.84 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0735  diadenosine tetraphosphatase  47.96 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0561  diadenosine tetraphosphatase  47.92 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  46.47 
 
 		 283 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  45.25 
 
 		 268 aa  244  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0922  diadenosine tetraphosphatase  51.54 
 
 		 272 aa  244  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0753757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  46.39 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  46.21 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04647  diadenosine tetraphosphatase  48.56 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0097  diadenosine tetraphosphatase  46.21 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  46.21 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0092  diadenosine tetraphosphatase  46.21 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.533237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3834  diadenosine tetraphosphatase  45.28 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  45.83 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1290  diadenosine tetraphosphatase  47.31 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00053  diadenosinetetraphosphatase  45.83 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3550  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.83 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0055  diadenosine tetraphosphatase  45.83 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0053  diadenosine tetraphosphatase  45.83 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0296879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3606  diadenosine tetraphosphatase  45.83 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0054  diadenosine tetraphosphatase  45.83 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00052  hypothetical protein  45.83 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0043  diadenosine tetraphosphatase  45.83 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  46.21 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1354  diadenosine tetraphosphatase  46.92 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0053  diadenosine tetraphosphatase  45.83 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.627509  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3506  diadenosine tetraphosphatase  47.01 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  46.3 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0722  diadenosine tetraphosphatase  46.79 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3637  diadenosine tetraphosphatase  45.28 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0600  diadenosine tetraphosphatase  46.79 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  42.65 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3446  diadenosine tetraphosphatase  43.96 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3575  diadenosine tetraphosphatase  43.96 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2085  diadenosine tetraphosphatase  45.93 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0097  diadenosine tetraphosphatase  45.56 
 
 		 291 aa  228  6e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0774  diadenosine tetraphosphatase  43.59 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0469096  normal  0.0479876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0367  diadenosine tetraphosphatase  44.07 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>