50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1831 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1831  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  889    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2270  hypothetical protein  48 
 
 
454 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  41.65 
 
 
1138 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1910  hypothetical protein  48.73 
 
 
298 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0184163  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2707  metallophosphoesterase  39.43 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  39.59 
 
 
311 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  36.22 
 
 
309 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  38.31 
 
 
329 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0277  hypothetical protein  35.37 
 
 
323 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  34.92 
 
 
314 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  33.43 
 
 
352 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  31.89 
 
 
324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  33.87 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  31.49 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  33.67 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  29.5 
 
 
338 aa  136  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
323 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
323 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  31.29 
 
 
323 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  31.27 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  30.62 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  28.43 
 
 
335 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  29.21 
 
 
323 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0165  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  41.98 
 
 
830 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  40.51 
 
 
847 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  43.04 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  35.63 
 
 
847 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0908  diadenosine tetraphosphatase  38.96 
 
 
278 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140647  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1455  diadenosine tetraphosphatase  38.82 
 
 
280 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  37.8 
 
 
870 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
870 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  40 
 
 
852 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0962  diadenosine tetraphosphatase  38.82 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04713  Ser/Thr protein phosphatase family (AFU_orthologue; AFUA_5G08620)  37.97 
 
 
259 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  31.08 
 
 
242 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  34.48 
 
 
850 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  37.35 
 
 
853 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  37.8 
 
 
447 aa  46.6  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  37.35 
 
 
863 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
254 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  37.35 
 
 
877 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  30.83 
 
 
246 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
857 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  38.16 
 
 
230 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
243 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>