92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2270 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  946    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1831  hypothetical protein  48 
 
 		 427 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.87 
 
 		 1138 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1910  hypothetical protein  46.13 
 
 		 298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0184163  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  42.27 
 
 		 311 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2707  metallophosphoesterase  37.33 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  40.33 
 
 		 309 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  36.74 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  37.54 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0277  hypothetical protein  35.15 
 
 		 323 aa  170  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  35.15 
 
 		 314 aa  170  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  34.27 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  31.15 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  31.61 
 
 		 324 aa  153  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  29.31 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  29.53 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  28.21 
 
 		 335 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  30.19 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  30.19 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  30.3 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  29.43 
 
 		 326 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  29.43 
 
 		 326 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  29.55 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  30.59 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  29.93 
 
 		 321 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.19 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.19 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  31.93 
 
 		 243 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.19 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  31.47 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  37.36 
 
 		 863 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  32.92 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  30.14 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  30.82 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  28.74 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  33 
 
 		 850 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  27.34 
 
 		 261 aa  57  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  36.17 
 
 		 870 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  32.69 
 
 		 877 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 830 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  34.04 
 
 		 852 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  34.07 
 
 		 847 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  36.71 
 
 		 847 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  34.48 
 
 		 847 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  32.68 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  26.67 
 
 		 229 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  36.14 
 
 		 853 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0778  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  38.67 
 
 		 245 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  32.65 
 
 		 852 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  34.12 
 
 		 273 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0908  diadenosine tetraphosphatase  35.23 
 
 		 278 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  28.17 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  37.08 
 
 		 859 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1664  metallophosphoesterase  25.97 
 
 		 269 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0848196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  36.59 
 
 		 870 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  26.57 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  29.08 
 
 		 278 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1633  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  36 
 
 		 245 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  27.97 
 
 		 279 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  29.47 
 
 		 857 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  29.23 
 
 		 275 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  29.73 
 
 		 282 aa  47.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  37.8 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09581  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.95 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  32.56 
 
 		 858 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0404  metallophosphoesterase  31.4 
 
 		 229 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  32.26 
 
 		 852 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0962  diadenosine tetraphosphatase  38.82 
 
 		 280 aa  47  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0165  metallophosphoesterase  36.14 
 
 		 213 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  31.94 
 
 		 206 aa  47  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1455  diadenosine tetraphosphatase  37.65 
 
 		 280 aa  46.6  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  39.29 
 
 		 834 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  34.94 
 
 		 235 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  31.03 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  30.14 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  29.71 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  36.9 
 
 		 854 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  28.77 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  36.26 
 
 		 852 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  37.33 
 
 		 234 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  37.33 
 
 		 224 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43482  predicted protein  29.89 
 
 		 1225 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  37.18 
 
 		 268 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1549  metallophosphoesterase  31.25 
 
 		 287 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.253978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  23.35 
 
 		 244 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  30.34 
 
 		 244 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.84 
 
 		 287 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  25.15 
 
 		 258 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0052  metallophosphoesterase  26.35 
 
 		 267 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04713  Ser/Thr protein phosphatase family (AFU_orthologue; AFUA_5G08620)  28.42 
 
 		 259 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 253 aa  43.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>