More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0240 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  100 
 
 
279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  81.72 
 
 
279 aa  491  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  52.81 
 
 
282 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0573  diadenosine tetraphosphatase  50.92 
 
 
296 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3200  diadenosine tetraphosphatase  53.43 
 
 
285 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.238496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0681  diadenosine tetraphosphatase  52.24 
 
 
283 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2736  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0711  diadenosine tetraphosphatase  53.04 
 
 
277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3027  diadenosine tetraphosphatase  50.36 
 
 
282 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3968  diadenosine tetraphosphatase  48.72 
 
 
279 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383712  normal  0.638877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0876  diadenosine tetraphosphatase  53.17 
 
 
292 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1143  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
281 aa  278  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281223  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3805  diadenosine tetraphosphatase  54.37 
 
 
292 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1064  diadenosine tetraphosphatase  49.63 
 
 
281 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3856  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
283 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0743  diadenosine tetraphosphatase  47.43 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1518  diadenosine tetraphosphatase  52.31 
 
 
284 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2518  diadenosine tetraphosphatase  50.78 
 
 
278 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.284049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0760  diadenosine tetraphosphatase  48.31 
 
 
279 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1149  diadenosine tetraphosphatase  50.19 
 
 
280 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0841  diadenosine tetraphosphatase  48.51 
 
 
279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1468  diadenosine tetraphosphatase  48.71 
 
 
282 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.85659  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0388  diadenosine tetraphosphatase  47.79 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0870  diadenosine tetraphosphatase  47.79 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
273 aa  265  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2156  diadenosine tetraphosphatase  47.83 
 
 
281 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.699429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0206  diadenosine tetraphosphatase  50.19 
 
 
275 aa  264  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2321  diadenosine tetraphosphatase  49.62 
 
 
282 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  50.39 
 
 
277 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2384  diadenosine tetraphosphatase  46.3 
 
 
273 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2728  diadenosine tetraphosphatase  49.08 
 
 
270 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  49.45 
 
 
273 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  47.6 
 
 
276 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  49.44 
 
 
275 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1991  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
282 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2752  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
282 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.541126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1853  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
282 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0922  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
282 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3164  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
282 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3142  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
282 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3106  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1340  diadenosine tetraphosphatase  44.12 
 
 
275 aa  248  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00498916  hitchhiker  0.000879118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  50.39 
 
 
288 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  48.88 
 
 
283 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  49.25 
 
 
283 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  50.39 
 
 
293 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  47.27 
 
 
265 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46850  diadenosine tetraphosphatase  47.83 
 
 
277 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4629  diadenosine tetraphosphatase  49.42 
 
 
291 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  48.65 
 
 
272 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  47.84 
 
 
278 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  49.61 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  48.84 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0549  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase, symmetrical  48.65 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  48.84 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0053  diadenosine tetraphosphatase  48.26 
 
 
280 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0296879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0055  diadenosine tetraphosphatase  48.26 
 
 
280 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0054  diadenosine tetraphosphatase  48.26 
 
 
282 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257316  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00053  diadenosinetetraphosphatase  48.26 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3550  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  48.26 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00052  hypothetical protein  48.26 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0043  diadenosine tetraphosphatase  48.26 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0053  diadenosine tetraphosphatase  48.26 
 
 
282 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.627509  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3606  diadenosine tetraphosphatase  48.26 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367142 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1345  diadenosine tetraphosphatase  44.77 
 
 
278 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.399511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0722  diadenosine tetraphosphatase  46.36 
 
 
283 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0922  diadenosine tetraphosphatase  46.33 
 
 
272 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0753757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  43.68 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  46.72 
 
 
282 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0097  diadenosine tetraphosphatase  46.72 
 
 
282 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  46.72 
 
 
282 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0092  diadenosine tetraphosphatase  46.72 
 
 
282 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.533237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  43.18 
 
 
268 aa  232  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  46.72 
 
 
282 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  46.33 
 
 
282 aa  231  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  44.11 
 
 
269 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  44.36 
 
 
268 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3506  diadenosine tetraphosphatase  43.89 
 
 
267 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3637  diadenosine tetraphosphatase  45.56 
 
 
281 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0600  diadenosine tetraphosphatase  44.53 
 
 
280 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3446  diadenosine tetraphosphatase  45.17 
 
 
289 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3575  diadenosine tetraphosphatase  45.17 
 
 
289 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0774  diadenosine tetraphosphatase  45.17 
 
 
289 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0469096  normal  0.0479876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3834  diadenosine tetraphosphatase  44.4 
 
 
281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0561  diadenosine tetraphosphatase  45.17 
 
 
281 aa  224  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0223  diadenosine tetraphosphatase  42.7 
 
 
279 aa  224  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  41.35 
 
 
282 aa  222  6e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0562  diadenosine tetraphosphatase  41.49 
 
 
288 aa  219  3e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0666  diadenosine tetraphosphatase  44.64 
 
 
344 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1354  diadenosine tetraphosphatase  43.66 
 
 
294 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226554  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0367  diadenosine tetraphosphatase  43.51 
 
 
273 aa  215  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1983  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.94 
 
 
275 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26306  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1197  diadenosine tetraphosphatase  41.67 
 
 
278 aa  214  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0643097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0735  diadenosine tetraphosphatase  45.69 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1290  diadenosine tetraphosphatase  43.31 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1558  diadenosine tetraphosphatase  42.47 
 
 
273 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04647  diadenosine tetraphosphatase  43.57 
 
 
318 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  41.91 
 
 
287 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1046  diadenosine tetraphosphatase  43.85 
 
 
276 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.78168  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2993  diadenosine tetraphosphatase  44.15 
 
 
276 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>