42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2707 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2707  metallophosphoesterase  100 
 
 
412 aa  848    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1910  hypothetical protein  52.54 
 
 
298 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0184163  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2270  hypothetical protein  37.33 
 
 
454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  36.26 
 
 
1138 aa  236  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1831  hypothetical protein  39.43 
 
 
427 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
309 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
311 aa  130  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  29.94 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0277  hypothetical protein  27.07 
 
 
323 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  27.94 
 
 
314 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  24.08 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  25.91 
 
 
324 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  26.04 
 
 
326 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  25.32 
 
 
326 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  25.81 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  26.99 
 
 
350 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
323 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
323 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  30.5 
 
 
352 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  25 
 
 
323 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  25.72 
 
 
323 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
323 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  23.67 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  24.2 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  24.64 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  24.04 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  26.71 
 
 
360 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  22.47 
 
 
279 aa  47  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  26.26 
 
 
254 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0475  metallophosphoesterase  29.47 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  30.59 
 
 
852 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0052  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
864 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  29.09 
 
 
863 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0165  metallophosphoesterase  33.71 
 
 
213 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
870 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  26.83 
 
 
243 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  23.78 
 
 
251 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
261 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  32.94 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  30.08 
 
 
286 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0050  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
260 aa  43.1  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>