285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3200 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3200  diadenosine tetraphosphatase  100 
 
 
285 aa  583  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.238496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1518  diadenosine tetraphosphatase  73.31 
 
 
284 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3856  diadenosine tetraphosphatase  59.58 
 
 
283 aa  333  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3027  diadenosine tetraphosphatase  60.07 
 
 
282 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2156  diadenosine tetraphosphatase  62.02 
 
 
281 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.699429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2384  diadenosine tetraphosphatase  59.64 
 
 
273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  58.72 
 
 
273 aa  322  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1064  diadenosine tetraphosphatase  57.69 
 
 
281 aa  318  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1143  diadenosine tetraphosphatase  57.34 
 
 
281 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281223  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1149  diadenosine tetraphosphatase  59.09 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1340  diadenosine tetraphosphatase  59.14 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00498916  hitchhiker  0.000879118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0681  diadenosine tetraphosphatase  55.59 
 
 
283 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0573  diadenosine tetraphosphatase  54.29 
 
 
296 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  52.8 
 
 
282 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  53.43 
 
 
279 aa  288  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2736  diadenosine tetraphosphatase  50.72 
 
 
293 aa  281  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0711  diadenosine tetraphosphatase  52.46 
 
 
277 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  50.35 
 
 
273 aa  278  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0743  diadenosine tetraphosphatase  50.9 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2518  diadenosine tetraphosphatase  48.94 
 
 
278 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.284049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0760  diadenosine tetraphosphatase  49.64 
 
 
279 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  51.88 
 
 
279 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0206  diadenosine tetraphosphatase  49.63 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  50.18 
 
 
277 aa  268  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0876  diadenosine tetraphosphatase  50.36 
 
 
292 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0841  diadenosine tetraphosphatase  49.65 
 
 
279 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3968  diadenosine tetraphosphatase  49.46 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383712  normal  0.638877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2728  diadenosine tetraphosphatase  51.61 
 
 
270 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0388  diadenosine tetraphosphatase  49.46 
 
 
279 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0870  diadenosine tetraphosphatase  49.46 
 
 
279 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3805  diadenosine tetraphosphatase  49.82 
 
 
292 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1468  diadenosine tetraphosphatase  49.82 
 
 
282 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.85659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2321  diadenosine tetraphosphatase  48.71 
 
 
282 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0922  diadenosine tetraphosphatase  53.44 
 
 
272 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0753757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3164  diadenosine tetraphosphatase  49.82 
 
 
282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3142  diadenosine tetraphosphatase  49.82 
 
 
282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3106  diadenosine tetraphosphatase  49.82 
 
 
282 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  48.46 
 
 
288 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  47.48 
 
 
276 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1991  diadenosine tetraphosphatase  49.45 
 
 
282 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1853  diadenosine tetraphosphatase  49.45 
 
 
282 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2752  diadenosine tetraphosphatase  49.45 
 
 
282 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.541126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0922  diadenosine tetraphosphatase  49.45 
 
 
282 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46850  diadenosine tetraphosphatase  47.33 
 
 
277 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  47.69 
 
 
288 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  49.64 
 
 
265 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  49.62 
 
 
272 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  46.15 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  46.15 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  48.08 
 
 
283 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0549  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase, symmetrical  47.89 
 
 
300 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  43.77 
 
 
275 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  47.69 
 
 
283 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  47.51 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4629  diadenosine tetraphosphatase  48.28 
 
 
291 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3506  diadenosine tetraphosphatase  46.38 
 
 
267 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  46.1 
 
 
278 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0223  diadenosine tetraphosphatase  44.95 
 
 
279 aa  232  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1345  diadenosine tetraphosphatase  46.79 
 
 
278 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.399511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1983  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  46.82 
 
 
275 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26306  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00053  diadenosinetetraphosphatase  43.89 
 
 
280 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0043  diadenosine tetraphosphatase  43.89 
 
 
280 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3550  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.89 
 
 
280 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3606  diadenosine tetraphosphatase  43.89 
 
 
280 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0055  diadenosine tetraphosphatase  43.89 
 
 
280 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0053  diadenosine tetraphosphatase  43.89 
 
 
280 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0296879  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00052  hypothetical protein  43.89 
 
 
280 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0054  diadenosine tetraphosphatase  43.89 
 
 
282 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257316  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0053  diadenosine tetraphosphatase  43.89 
 
 
282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.627509  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1197  diadenosine tetraphosphatase  45.55 
 
 
278 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0643097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.84 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1046  diadenosine tetraphosphatase  43.94 
 
 
276 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.78168  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03416  diadenosine tetraphosphatase  42.7 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0436512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
282 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0097  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
282 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
282 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
282 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0092  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
282 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.533237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3834  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
281 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0561  diadenosine tetraphosphatase  41.98 
 
 
281 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  43.53 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  40.84 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3637  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  42.53 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  41.06 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0600  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  40.61 
 
 
268 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0666  diadenosine tetraphosphatase  44.41 
 
 
344 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3446  diadenosine tetraphosphatase  41.98 
 
 
289 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3575  diadenosine tetraphosphatase  41.98 
 
 
289 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0774  diadenosine tetraphosphatase  41.98 
 
 
289 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0469096  normal  0.0479876 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1290  diadenosine tetraphosphatase  45.32 
 
 
295 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0722  diadenosine tetraphosphatase  41.98 
 
 
283 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04647  diadenosine tetraphosphatase  43.71 
 
 
318 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0097  diadenosine tetraphosphatase  42.81 
 
 
291 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1354  diadenosine tetraphosphatase  45.32 
 
 
294 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226554  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2085  diadenosine tetraphosphatase  42.81 
 
 
291 aa  205  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1558  diadenosine tetraphosphatase  40.08 
 
 
273 aa  205  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0735  diadenosine tetraphosphatase  42.6 
 
 
271 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0562  diadenosine tetraphosphatase  38.43 
 
 
288 aa  204  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>