More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3210 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3210  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5174  Ppx/GppA phosphatase  59.2 
 
 
298 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985402  normal  0.0128836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  41.25 
 
 
306 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  40.2 
 
 
311 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  40.27 
 
 
314 aa  216  3e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  39.03 
 
 
321 aa  215  9e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  32.18 
 
 
319 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  32.34 
 
 
311 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  31.58 
 
 
519 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 
519 aa  140  2e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  31.58 
 
 
519 aa  137  3e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  30.41 
 
 
520 aa  134  2e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.85 
 
 
570 aa  133  4e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  30.39 
 
 
521 aa  132  7e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  29.83 
 
 
534 aa  130  2e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.87 
 
 
549 aa  131  2e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  29.08 
 
 
514 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  30.33 
 
 
308 aa  130  4e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  29.49 
 
 
527 aa  128  1e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 
550 aa  127  2e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
318 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  27.95 
 
 
307 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0340  Ppx/GppA phosphatase  29.33 
 
 
310 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00977932  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  31.9 
 
 
330 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  26.48 
 
 
353 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
521 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
524 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 
545 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 
545 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
313 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  28.2 
 
 
312 aa  121  1e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 
314 aa  122  1e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  27.54 
 
 
557 aa  120  2e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  30.97 
 
 
544 aa  120  2e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  29.35 
 
 
511 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  29.35 
 
 
511 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 
328 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  30.28 
 
 
326 aa  119  5e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  30.16 
 
 
544 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  28.86 
 
 
507 aa  117  2e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  27.69 
 
 
545 aa  117  2e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 
320 aa  117  2e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
303 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 
550 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  32.23 
 
 
303 aa  116  4e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  29.9 
 
 
307 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4108  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.43 
 
 
305 aa  116  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000620786  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  27.3 
 
 
505 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0515  Ppx/GppA phosphatase  29.87 
 
 
311 aa  115  8e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0411  Ppx/GppA phosphatase  28.67 
 
 
308 aa  115  8e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  25.51 
 
 
505 aa  115  8e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  27.67 
 
 
502 aa  115  1e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3431  Ppx/GppA phosphatase  30.54 
 
 
308 aa  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  28.2 
 
 
304 aa  114  1e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
513 aa  114  2e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
315 aa  114  2e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
513 aa  114  2e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
513 aa  114  2e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
513 aa  114  2e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  28.44 
 
 
331 aa  114  2e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  29.3 
 
 
315 aa  114  2e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  29.01 
 
 
513 aa  114  2e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  28.33 
 
 
509 aa  114  2e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  29.01 
 
 
513 aa  114  2e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
513 aa  114  2e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  30.21 
 
 
311 aa  114  2e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  30.97 
 
 
321 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0450  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.67 
 
 
310 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
519 aa  113  4e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  29.74 
 
 
504 aa  113  4e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
519 aa  113  4e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  29.74 
 
 
504 aa  113  4e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  29.29 
 
 
516 aa  113  4e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
519 aa  113  4e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  29.01 
 
 
513 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  28.06 
 
 
513 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
318 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  28.48 
 
 
509 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  28.09 
 
 
311 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  28.67 
 
 
513 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  26.89 
 
 
531 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 
309 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 
309 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 
309 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  27.7 
 
 
500 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  27.36 
 
 
500 aa  112  8e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  28.48 
 
 
310 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
513 aa  111  1e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
504 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
504 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  29.67 
 
 
510 aa  112  1e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.31495e-15 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
504 aa  111  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
504 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  26.89 
 
 
531 aa  111  1e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  28.66 
 
 
305 aa  111  2e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.36687e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  28.48 
 
 
513 aa  110  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
504 aa  111  2e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  27.72 
 
 
519 aa  110  2e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  28.75 
 
 
549 aa  111  2e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  29.67 
 
 
511 aa  110  2e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>