22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2428 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  36.61 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  33.86 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2650  protein of unknown function DUF1486  24.81 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.679819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  30.09 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4344  hypothetical protein  31.39 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  30.16 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  32.2 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  29.2 
 
 		 359 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  27.19 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2864  hypothetical protein  22.73 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  25.38 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  25.38 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  26.23 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  22.66 
 
 		 137 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  26.23 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  21.43 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  0.00000936825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3203  hypothetical protein  22.34 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0185892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  23.97 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  26.19 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  26.19 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  26.19 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>