More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2404 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  68.09 
 
 		 483 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  63.94 
 
 		 482 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  64.18 
 
 		 485 aa  673    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02427  6-phosphogluconate dehydrogenase  64.93 
 
 		 482 aa  668    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.31 
 
 		 484 aa  732    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0339  6-phosphogluconate dehydrogenase  65.55 
 
 		 482 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00114124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 		 484 aa  993    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  65.14 
 
 		 482 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.19 
 
 		 489 aa  752    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1654  6-phosphogluconate dehydrogenase  63.84 
 
 		 484 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0057587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  71.37 
 
 		 484 aa  742    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.25 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2752  6-phosphogluconate dehydrogenase  60.04 
 
 		 482 aa  620  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03954  hypothetical protein similar to 6-phosphogluconate dehydrogenase (Eurofung)  61.32 
 
 		 490 aa  612  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0543109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  61.7 
 
 		 477 aa  607  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  61.59 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69500  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.32 
 
 		 508 aa  598  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239936  normal  0.16474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.91 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.44 
 
 		 471 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01050  phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating), putative  57.82 
 
 		 491 aa  566  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1834  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.73 
 
 		 473 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1275  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  57.14 
 
 		 476 aa  556  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.374225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.9 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.9 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.06 
 
 		 469 aa  554  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  58.67 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.63 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.06 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.06 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.6 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.82 
 
 		 471 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.17 
 
 		 472 aa  550  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.36 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.36 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.17 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.17 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.17 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.17 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.17 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.17 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.79 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.14 
 
 		 475 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  56.68 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.91 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2527  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.22 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.33 
 
 		 470 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.75 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.91 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.91 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.13 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.89 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.89 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.33 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.47 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.56 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.89 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.89 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  56.68 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.56 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.89 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.97 
 
 		 501 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.33 
 
 		 470 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  54.74 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.47 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.47 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 		 468 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0925  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.7 
 
 		 480 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 		 468 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.77 
 
 		 468 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.12 
 
 		 470 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 		 468 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 		 468 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.25 
 
 		 468 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.91 
 
 		 470 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 		 468 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.25 
 
 		 468 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.7 
 
 		 468 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.6 
 
 		 469 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_002620  TC0333  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.48 
 
 		 479 aa  521  1e-146  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2810  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.29 
 
 		 468 aa  521  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2765  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.29 
 
 		 468 aa  521  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  52.24 
 
 		 475 aa  518  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.66 
 
 		 523 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2069  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.47 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.531978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16410  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  51.87 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0443  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.96 
 
 		 472 aa  513  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1071  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.33 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.75 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  51.67 
 
 		 484 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1950  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.64 
 
 		 505 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0397  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.76 
 
 		 468 aa  508  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0180  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.74 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2811  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  51.39 
 
 		 482 aa  502  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3598  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.79 
 
 		 486 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5683  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  50.21 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696376  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1889  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  50.74 
 
 		 483 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0324159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07950  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.63 
 
 		 486 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.367535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>