More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1905 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
245 aa  511  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.83 
 
 
239 aa  319  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  58.58 
 
 
246 aa  304  9.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  43.1 
 
 
241 aa  224  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.18 
 
 
248 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  42.19 
 
 
242 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  40.6 
 
 
260 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.35 
 
 
244 aa  215  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.59 
 
 
241 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.59 
 
 
241 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  41.77 
 
 
263 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  42.26 
 
 
240 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  41.42 
 
 
241 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.84 
 
 
240 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  40.17 
 
 
240 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  42.55 
 
 
236 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  39.75 
 
 
241 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  41.42 
 
 
240 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  41.84 
 
 
240 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  40.59 
 
 
240 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3065  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.89 
 
 
247 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.42 
 
 
240 aa  208  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.6 
 
 
246 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.86 
 
 
259 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  40.59 
 
 
240 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  40.59 
 
 
240 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  40.59 
 
 
240 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  40.59 
 
 
240 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  40.59 
 
 
240 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  40.59 
 
 
240 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  40.59 
 
 
263 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  41 
 
 
240 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41 
 
 
240 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  41 
 
 
240 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.08 
 
 
239 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.51 
 
 
238 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  43.04 
 
 
245 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  41.35 
 
 
266 aa  201  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.68 
 
 
270 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0695  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.71 
 
 
244 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3173  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.3 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  39.42 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  38.82 
 
 
270 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  40.17 
 
 
242 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  39.75 
 
 
242 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  39.33 
 
 
242 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  39.33 
 
 
242 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  39.33 
 
 
246 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2975  hypothetical protein  40.49 
 
 
259 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.37 
 
 
256 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.35 
 
 
256 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2946  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.18 
 
 
244 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  37.75 
 
 
247 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.18 
 
 
246 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.45 
 
 
257 aa  191  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  40 
 
 
243 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39.58 
 
 
247 aa  190  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3932  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.46 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  37.76 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  37.76 
 
 
268 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  37.76 
 
 
268 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  37.76 
 
 
268 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  37.76 
 
 
268 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  37.76 
 
 
268 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  188  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  42.02 
 
 
260 aa  188  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.76 
 
 
248 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  38.4 
 
 
239 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  38.4 
 
 
239 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4212  hypothetical protein  37.65 
 
 
246 aa  186  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  38.4 
 
 
239 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.58 
 
 
240 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1176  putative oxidoreductase  40.56 
 
 
247 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199647  normal  0.198576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  185  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  185  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2645  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.96 
 
 
247 aa  184  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5817  hypothetical protein  41.06 
 
 
247 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537036  normal  0.103138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  40.76 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  36.82 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_002950  PG1171  oxidoreductase, putative  38.21 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5743  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.89 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.044378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  39.24 
 
 
234 aa  181  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.86 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.92 
 
 
247 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  38.14 
 
 
243 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2615  hypothetical protein  40.24 
 
 
247 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0980997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2838  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.65 
 
 
247 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0236915  normal  0.339029 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  38.14 
 
 
256 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  37.97 
 
 
274 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  37.7 
 
 
261 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  37.86 
 
 
250 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  36.71 
 
 
241 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2930  hypothetical protein  39.36 
 
 
247 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.656633  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.24 
 
 
265 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04070  Fe-S oxidoreductase  37.82 
 
 
244 aa  179  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0880878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>