More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1543 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  100 
 
 		 52 aa  101  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  90.2 
 
 		 52 aa  90.5  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  82.35 
 
 		 52 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  80.39 
 
 		 52 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  87.23 
 
 		 52 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  82 
 
 		 53 aa  81.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  87.23 
 
 		 53 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  82.98 
 
 		 55 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  82.98 
 
 		 50 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  82.61 
 
 		 53 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 51 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 53 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  80.43 
 
 		 53 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 51 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  72.34 
 
 		 53 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  76.09 
 
 		 53 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  74.47 
 
 		 52 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1719  hypothetical protein  84.31 
 
 		 52 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.694147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 46 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 46 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 		 46 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  77.27 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 48 aa  63.2  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  76.19 
 
 		 45 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 48 aa  62  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 47 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  68.89 
 
 		 52 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  71.43 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  67.44 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  63.83 
 
 		 51 aa  57.8  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  69.05 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>