177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1026 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  100 
 
 
243 aa  497  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  79.27 
 
 
246 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  78.46 
 
 
246 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  79.18 
 
 
247 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  78.37 
 
 
260 aa  397  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  78.78 
 
 
247 aa  399  1e-110  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  77.42 
 
 
253 aa  398  1e-110  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.84 
 
 
242 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  5.49688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  66.26 
 
 
242 aa  350  9e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  59.26 
 
 
244 aa  309  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  57.5 
 
 
241 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.27 
 
 
245 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.93 
 
 
237 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.93 
 
 
237 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.93 
 
 
237 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.93 
 
 
237 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.47 
 
 
237 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.93 
 
 
264 aa  184  1e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.66 
 
 
241 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.05 
 
 
236 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.6 
 
 
242 aa  182  4e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  43.17 
 
 
236 aa  182  5e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.17 
 
 
236 aa  182  5e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.17 
 
 
236 aa  182  5e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.55 
 
 
236 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.17 
 
 
236 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  42.73 
 
 
236 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  42.73 
 
 
236 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.73 
 
 
236 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.95 
 
 
237 aa  179  3e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.8 
 
 
242 aa  178  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  39.91 
 
 
244 aa  174  1e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.77 
 
 
245 aa  172  4e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.55 
 
 
241 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.42 
 
 
238 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.68 
 
 
241 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.55 
 
 
241 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.55 
 
 
241 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.55 
 
 
241 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.62 
 
 
242 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  42.86 
 
 
245 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.01453e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.52 
 
 
240 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.83 
 
 
238 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.83 
 
 
238 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.83 
 
 
238 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.34 
 
 
238 aa  168  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.86 
 
 
241 aa  168  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.36 
 
 
241 aa  166  3e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.36 
 
 
241 aa  166  3e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  40.65 
 
 
265 aa  166  3e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.28 
 
 
241 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.63 
 
 
238 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.36 
 
 
241 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  37.99 
 
 
238 aa  164  1e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.98401e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.11 
 
 
238 aa  163  2e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  37.93 
 
 
255 aa  163  2e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  40.47 
 
 
263 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  38.46 
 
 
285 aa  162  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.51 
 
 
239 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.1 
 
 
251 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.26 
 
 
241 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  40.1 
 
 
262 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.82 
 
 
242 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.86403e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  37.18 
 
 
285 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  40.1 
 
 
262 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  40.89 
 
 
232 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.38 
 
 
261 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.24 
 
 
251 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.5 
 
 
210 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  37.89 
 
 
277 aa  152  6e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  36.24 
 
 
254 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  35.21 
 
 
245 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  40.74 
 
 
258 aa  147  1e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  34.56 
 
 
237 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
250 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.98 
 
 
264 aa  138  9e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.51 
 
 
262 aa  127  2e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  32.69 
 
 
272 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  35.11 
 
 
246 aa  114  1e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  32.02 
 
 
241 aa  110  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  32.75 
 
 
248 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  32.02 
 
 
241 aa  109  4e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  32.37 
 
 
237 aa  109  4e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  34.45 
 
 
235 aa  108  9e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  30.1 
 
 
238 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  33.98 
 
 
249 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  32.55 
 
 
248 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.87 
 
 
247 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  31.14 
 
 
241 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  32.08 
 
 
248 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.05 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.05 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.76 
 
 
245 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.05 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.76 
 
 
245 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.05 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.05 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.46 
 
 
236 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  30.51 
 
 
242 aa  101  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.57 
 
 
245 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>