43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2504 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  349  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  56 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  56 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  55.56 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  48.52 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  53.25 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  40.24 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  39.29 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  38.51 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  32.35 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  37.93 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  33.99 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  34.69 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  35.84 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  32.89 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  35.26 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  35.26 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  30.87 
 
 		 191 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  32.21 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  30.61 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  33.53 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  33.54 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  30.2 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  29.33 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  32.76 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  32.19 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  32.12 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  28.82 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  25.15 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  26.32 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  28.12 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  25.95 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  25.32 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  25.32 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  27.21 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  31.36 
 
 		 312 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  25.85 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>