20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0486 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  47.32 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  48.72 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  39.24 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  39.24 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  43.59 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  45.68 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  34.65 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  41.03 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  42.42 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  31.87 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  29 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  32.95 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  31.43 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1885  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.528745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>